銀河鉄道９９９：エターナル編
アンドロメダへの旅から1年後 ９９９号が地球に戻ってきた
星野鉄郎はメーテルと再会し 再び９９９号で旅立つ
目的地は光の大星雲「エターナル」
第4話 無限大叙事詩第一楽章（エメラルダス自身は登場しない）
９９９の軌道をアルカディア号が横切った
メーテルはハーロックにエメラルダスの行方を尋ねる
しかしハーロックもエメラルダスの消息を知らないという
メーテルにとって エメラルダスの消息が分からなくなったのは初めてのことらしい
ヴァルキリーの戦士達も行方不明になったエメラルダスを捜している
第11話 惑星「静かな夢」（エメラルダス自身は登場しない）
停車中の９９９の上空にエメラルダス号が姿をあらわす
姿を見せておきながら先を急ぐエメラルダスをメーテルは不思議に思う
第12話 クイーン
エメラルダス
惑星メタ・ブラディにエメラルダスがあらわれる
メーテルはエメラルダスに今までどうしていたのか尋ねる
しかしエメラルダスはヴァルキリーと話し合いがあると言って去っていく
第17話 ダークィーン（エメラルダス自身は登場しない）
鉄郎は今持っている銃がエメラルダスのものであることを知る
パワーアップしないとメタノイドには勝てないため
改良の済んだエメラルダスの銃を鉄郎に渡したということだ
鉄郎の銃はエメラルダスが改良しているらしい
第20話 精霊の無限井戸
改良の済んだ鉄郎の銃を持ってエメラルダスが現れる
銃を交換して立ち去ろうとするエメラルダスに
メーテルはなぜそんなに急ぐのかと問いかける
フードで身体を覆っているエメラルダスをメーテルは心配する
第24話 クルミ割り人形
惑星クルミナイトの爆発後 エメラルダスは９９９に乗り込んでくる
クルミナイトを滅亡に追い込み 自分と家族だけで逃げた大統領に
次の駅で降りるように指示する
第30話 惑星大アマゾン・命の讃歌
ホテルにエメラルダスから電話があり危険を知らせてくる
惑星大アマゾンは砕けて消えてしまった
第32話 殺意と怒気の王女
惑星殺気怒気疑いにエメラルダス号があらわれる
殺気怒気疑いに応戦するが 崩壊した惑星の住民の避難を手伝う
第33話 惑星ハラキリ
惑星ハラキリに大暗黒遊星デス・スウォードが迫っていた
エメラルダスとハーロックは大統領に対策を呼びかけるが
大統領は責任の重大さを恐れて結論を出さない
ハラキリはデス・スウォードの衝突により砕けてしまった